بخشی از فعالیت مجموعه فرهنگی امام صادق(ع)  میبد به فعایت های پژوهشی مربوط است. در این بخش پژوهش گران و دانش آموختگان جوان با شیوه های پژوهش در موضوعات دینی آشنا گشته و در زمینه های مورد نظر به کارهای پژوهشی می پردازند. تا کنون بخشی از کارهای این گروه به چاپ رسیده، یا در دست چاپ و یا در حال آماده سازی است. مجموعه ی چکیده سازی کتاب های مفید و تأثیر گذار با عنوان «کتاب امروز» در ده ها جلد یکی از کارهای این بخش می باشد که در دست انتشار است. حجت‌الاسلام حسین انصاری مسئولیت تأسیس و مدیریت بخش پژوهش را بر عهده دارد.

در این بخش همراه با انجام پروژه های پژوهشی، کلاس هایی نیز در جهت ارتقاء سطح تحقیقات و کارایی پژوهشگران برپا می شود. به زودی بیوگرافی برخی از پژوهشگران همکاری کننده با مجموعه ی فرهنگی امام صادق(ع) میبد در همین صفحه در اختیار علاقمندان قرار خواهد گرفت.